英國廣播公司（BBC）報導，報告指出，對大堡礁帶來最大威脅的是氣候變化，目前已造成珊瑚白化、海洋酸化等問題。人類的海洋活動也對環境造成破壞。
流入海洋的地表水質量低、沿海開發、漁業等都對大堡礁生態構成威脅。當地和周邊地區需要做出更多努力來減少這種威脅，防止生態環境的繼續惡化，幫助珊瑚礁的恢復。
該報告也提到一些成功的經驗，比如減少流入堡礁污染物方面的投資取得效果，座頭鯨、河口鱷等物種的數量也開始回升。大堡礁是世界上最大的珊瑚礁群，海洋生物豐富。大堡礁沿澳洲東海岸綿延2600公里，包括400種珊瑚，1500種魚類和4000種軟體動物。
大堡礁也被列入聯合國教科文組織世界遺產名錄，該組織近年來發出警告，並表示由於環境日益惡化，大堡礁有可能被列入瀕危名單。環保主義人士還擔心，昆士蘭州擴充阿博特角煤炭港口的計劃會進一步危及大堡礁。
澳洲環境部長亨特表示，解決這些問題不會一蹴而就，需要花很長時間來扭轉珊瑚礁的環境，並且需要政府、企業和社團的共同努力。每年用於改善環境的投資約1億6700萬美元（5億2980萬令吉），目前政府正在製定一個2015年至2050年的保護大堡礁的總體框架。
